terça-feira, 17 de maio de 2011

Você sequencia?

Quais são as aplicações do sequenciador no seu laboratório? Seu ABI faz muito mais que sequenciar.

O primeiro método de sequenciamento de DNA foi desenvolvido entre os anos de 1976 e 1977, pelos químicos Allan Maxam e Walter Gilbert, e baseava-se no tratamento do DNA, extraído do organismo ou célula de interesse, com substâncias químicas que clivavam a molécula em sítios específicos, dependendo da sua constituição de bases. 

A descoberta da estrutura do DNA em 1953, por Francis Crick e James Wattson, a partir da qual foi proposto um mecanismo fiel para cópia do material genético, serviu como base para o desenvolvimento de técnicas moleculares consagradas, como a PCR e o método enzimático de sequenciamento. 

Esse método de sequenciamento, desenvolvido por Frederick Sanger em 1977, e que lhe rendeu o prêmio nobel de química em 1980, baseia-se na terminação da cadeia crescente de DNA e utiliza dideoxinucleotídeos (ddNTPs), que quando são incorporados na fita de DNA, pela polimerase, interrompem o seu alongamento. Esses ddNTPs diferem dos deoxinucleotídeos normais (dNTPs) por possuírem um radical H ligado ao carbono 3 da pentose (açucar associado à molécula de DNA), enquanto os dNTPs possuem um radical OH nesta posição. Inicialmente os ddNTPs eram marcados com isótopos radiotaivos (32P ou 35S), que permitiam a sua detecção quando expostos a um raio X. 

A descoberta das moléculas fluorescentes, no final dos anos 1980, e o desenvolvimento dos sequenciadores automáticos de DNA, levaram a automatização da técnica de sequenciamento e a sua utilização em pesquisas nos mais variados campos das ciências biológicas. Atualmente, com todas as suas variações, o sequenciamento é uma das técnicas mais utilizadas não apenas na pesquisa, mas também no diagnóstico de doenças e condições fisiológicas e na identificação de patógenos.

Quais as linhas de pesquisa do seu laboratório? Você explora todas as possibilidades do seu sequenciador ABI? Veja abaixo as aplicações testadas e validadas para nossas plataformas de sequenciamento. Siga o link de cada plataforma e verifique em detalhes as suas especificações e aplicações.
Plataforma


3730xL

3730

3500xL

3500

3130xL

3130

310
Número de Capilares
96
48
24
8
16
4
1
Aplicações compatíveis:
(V) Validado; (A) Demonstrado pela AB; (C) Demonstrado por clientes; (N) Não suporta
BAC End Sequencing
V
V
V
V
V
V
V
Checking Clone Constructs
V
V
V
V
V
V
V
De NovoSequencing
V
V
V
V
V
V
V
Heterozygote Detection & Resequenicng (SNP-based)
V
V
V
V
V
V
A
HLA Typing
V
V
V
V
V
V
C
Methylation
V
V
V
V
V
V
C
mtDNA Sequencing
V
V
V
V
V
V
V
Resequencing
- Comparative Genomics
V
V
V
V
V
V
V
- Indels
V
V
V
V
V
V
V
SAGE™ Method
C
C
C
C
C
C
A
SNP Analysis
V
V
V
V
V
V
V
General Sizing of PCR Products
V
V
V
V
V
V
V
Fragment Length Polymorphism
- AFLP
V
V
V
V
V
V
V
- RFLP
A
A
A
A
A
A
A
Large Fragment Analysis
- BAC Fingerprinting
A
A
A
A
A
A
N
- VNTR
C
C
C
C
C
C
C
Microsatellite
- Genotyping
V
V
V
V
V
V
V
- Analysis for Forensics/HID
N
V
V
V
V
V
V
- Instability/RER
A
A
A
A
A
A
A
Chimerism Studies
C
C
C
C
C
C
C
Conformation Analysis
- SSCP
N
N
N
N
A
A
V
Relative Flourescent Quantitation
- Loss of Heterozygosity (LOH)
V
V
V
V
V
V
V
SNP Genotyping
- SNaPshot® System
A
A
V
V
V
V
V
- SNPlex™ System
V
V
V
V
V
N
N
DNA Protein Binding Assays & DNA Fingerprinting
C
C
C
C
C
C
C

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